Sekretariat Badan Kepegawaian dan Pengembangan Sumber Daya Manusia Daerah mempunyai tugas melaksanakan pelayanan teknis dan administrasi bagi seluruh unit organisasi Badan Kepegawaian dan Pengembangan Sumber Daya Manusia Daerah Kota Palu.

Sekretariat Badan menyelenggarakan fungsi :

Penyusunan rencana dan program;
Pengelooan administrasi keuangan;
Pengelolaan administrasi kepegawaian;
Pelaksanaan ketatausahaan;
Pengelolaan barang milik negara dan rumah tangga; dan
Pelaksanaan dokumentasi dan hubungan masyarakat.
Sekretariat Badan terdiri atas :

Sub Bagian Perencanaan Program dan Keuangan
Sub Bagian Kepegawaian dan Umum